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从“神舟”五号太空飞行的23小时，到“神舟”六号的至少5天，并不仅仅是时间上的简单延长，无论对飞船制造和控制技术，还是对在太空中工作和生活的航天员来说，都意味着更大的挑战，更高的要求。航天员长期太空飞行中，下面三个问题必须引起重视。难题一缺水解决方案航天员汗水也得回收
载人航天活动中，由于远离水源，水更显得弥足珍贵。每人每天约需水量30公斤，仅靠储存用水和收集的冷凝水，显然是远远不够的。为解决长期载人航天活动中大量的用水问题，只能考虑水的再循环，即废水的再利用。航天活动中乘员呼出的潮气、汗水，尿液、粪便中的含水，乘员洗脸、洗澡、洗衣及个人卫生废水，食品配制与用餐中生成的废水以及生物实验、植物栽培等产生的废水，都可以进入水的再循环系统，经过专业的处理之后，再作为饮用水、生活用水、工作用水等投入使用。难题二疾病解决方案 航天医师地面监控指导
太空环境极其恶劣，给航天员健康带来危害。因此，航天专家们要对航天员进行医学监督与医学保障。医学监督主要用来监护航天员在航天全过程中的健康状况，监督涉及航天员健康和安全设备的运行情况等。飞行中的医学监督主要靠遥测、航天员的自测与互测和通讯系统传送医学信息和数据。航天医师通过地面站的医监台，监视从太空发回的各种数据，并通过电视与航天员直接对话，对其身体状况作出综合性的判断和预测。难题三交流解决方案 人际关系得当处理
如果载人航天器搭载的是两个或多个航天员，对航天员来说，他们还面临着另一种无形的考验———人际关系。
乘员组人员与地面人员人际关系的处理是一个重要因素。在狭小的环境里，跟地面的联系是乘员们唯一与外界的交流，处理不当，很容易引起他们情绪沮丧、低落，甚至产生敌意。
此外，航天员还要和地面上的家人、朋友进行情感沟通和交流。目前，即使是航天专家对这种沟通的利弊也有着不同的看法。有人认为，这种沟通是必要的，可以减少航天员对家庭的思念和人际关系需要上对其他成员的依赖；而另外一些学者则认为，这种沟通是有害的，一些性急的航天员可能一直惦记与家人的关系而忽视自己的职责。
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